研究者強烈建議基因測試實驗室定期重新審查他們的記錄，并在科學(xué)發(fā)展導(dǎo)致基因被重新分類時提醒醫(yī)生。
“個性化醫(yī)療”或稱“精準醫(yī)療”的一個重要特點就是根據(jù)每個患者的自身特點和個體病情進行醫(yī)護，其中患者的遺傳特征占據(jù)非常重要的地位。檢測與遺傳性癌癥風(fēng)險相關(guān)的基因，可以在醫(yī)療管理中發(fā)揮重要作用。隨著基因測序的成本越來越低，其應(yīng)用也越來越普及。但基因檢測結(jié)果并不是一成不變的，對于結(jié)果的解讀仍然是個挑戰(zhàn)。
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近日，來自美國德州大學(xué)西南醫(yī)學(xué)中心（UT Southwestern Medical Center）的一項新研究結(jié)果顯示，當(dāng)回顧來自上百萬個體的基因檢測結(jié)果時，發(fā)現(xiàn)有近25％的“意義不明”的基因突變被重新分類，與癌癥的相關(guān)性出現(xiàn)了變化。因此，研究者強烈建議基因測試實驗室定期重新審查他們的記錄，并在科學(xué)發(fā)展導(dǎo)致基因被重新分類時提醒醫(yī)生。研究發(fā)表在《美國醫(yī)學(xué)會雜志》（JAMA）上。
人類大約有20,000個基因，其中尚有不少基因的功能和意義未明。典型的基因含有約27,000個堿基對（A-T，G-C），一些基因可以高達200萬個堿基對。當(dāng)堿基對出現(xiàn)變異時可能會影響其編碼的蛋白質(zhì)，有些變化會對癌癥風(fēng)險造成影響?；蛑械拇罅繅A基對意味著存在大量的潛在變異——與標準不同的序列——的可能性。因為大多數(shù)變異對人類健康幾乎沒有實際或者可觀察到的影響，這些變異必須被仔細評估，以確定其致病性。
2015年頒布的標準要求考慮幾種不同類型的證據(jù)，包括臨床觀察、家庭隔離、人口流行度以及計算和功能數(shù)據(jù)，但大多數(shù)變異的證據(jù)有限，關(guān)于致病性還是良性的結(jié)果常常是不確定、尚處于發(fā)展中的。一些之前并不了解的變異，隨著科學(xué)進展其意義可能會被闡明，因此對于基因測序結(jié)果也值得一再結(jié)合新進展來解讀。
當(dāng)在基因中發(fā)現(xiàn)變異時，它們被分類為“良性”、“可能是良性”、“意義不明”、 “可能致病性”或“致病性”。良性和致病性突變按定義為超過90％可能性。隨著時間的推移，基因變異可能會被重新分類，例如，從“意義不明”的變異轉(zhuǎn)化為“可能致病性”的變異，反之亦然。隨著科學(xué)發(fā)展，新的數(shù)據(jù)一直在涌現(xiàn)。
研究者可能會發(fā)現(xiàn)對癌癥易感的基因家族，并從其DNA中學(xué)到新東西。實驗室可以通過基因變異推定蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)并檢查是否有異常的形狀，或觀察具有變異基因的細胞表現(xiàn)良好還是不佳。如果家族、生化和功能數(shù)據(jù)均指向異常，那么這個基因變異會從“意義不明”的分類移至“致病性”。
在這項回顧性隊列研究中，研究者回顧了Myriad Genetics這個基因測序?qū)嶒炇以?0年間對癌癥基因的檢測結(jié)果以及來自UT西南大學(xué)癌癥遺傳學(xué)計劃的相關(guān)臨床數(shù)據(jù)，包括了145萬名被測試者和167萬份初始測試報告。
由于變異被重新分類，研究者一共發(fā)現(xiàn)了59,955份修訂報告。在最初被歸類為“意義不明”的變體中，7.7％被重新分類，其中91.2％被降級為不太嚴重的分類（良性，可能良性），8.7％被升級為更嚴重的分類（致病性，可能致病性）。但最初被歸類為致病性或良性的變異則很少有被重新分類的。
“如果一個變異被重新歸類為致病性變異，那么它對患者很重要，”該研究的高級作者，UT西南大學(xué)Harold C. Simmons綜合癌癥中心內(nèi)科醫(yī)學(xué)教授Theo Ross博士說：“比如說，如果患者具有缺陷的Lynch綜合征基因，那么他們需要個性化的醫(yī)療手段，例如在較早的年齡或更頻繁地進行結(jié)腸鏡檢查，有時甚至每年一次。又比如說，如果患者具有缺陷的BRCA基因，他們可能希望進行預(yù)防性乳腺移除手術(shù)，或在其乳房X光篩查計劃中增加MRI掃描項目?！?/span>
即使是從“意義不明”到“良性”的重新分類對患者來說也很重要，可以讓他們安心。這次的結(jié)果就顯示，重新分類的“意義不明”突變中，絕大多數(shù)（超過90%）都是良性或者可能良性的，這對于患者而言是能改善心理狀態(tài)甚至生活質(zhì)量的信息。
“這項研究的意義是三管齊下的。醫(yī)生需要了解基因變異的知識發(fā)展得多快，變異被重新分類是很常見的。實驗室需要定期檢查基因變異信息并提醒醫(yī)生改變。最后，患者及其家屬需要從醫(yī)生處了解變異的重新分類，以便做出明智的選擇，” Ross博士說。
參考資料
1. Genetic testing: Not a one-and-done deal, retrieved 2018/09/28, https://www.eurekalert.org/pub_releases/2018-09/usmc-gtn092518.php
2. Jacqueline Mersch et al., JAMA, 2018, doi:10.1001/jama.2018.13152
