11月22日,百度和賽諾菲宣布雙方達成合作,將百度自主研發(fā)的mRNA序列設計優(yōu)化算法LinearDesign整合到賽諾菲的產品設計管線,用于mRNA疫苗和藥物開發(fā)。據(jù)悉,百度在2018年便開展了RNA二級結構領域的研究,在2020年4月推出LinearDesign mRNA序列優(yōu)化算法,專門用于mRNA序列設計。目前,mRNA技術雖然已被成功商業(yè)化,但mRNA疫苗普遍穩(wěn)定性低,容易因降解而失效,成為影響其儲存、運輸和免疫原性的主要限制因素。LinearDesign通過動態(tài)規(guī)劃算法,將序列穩(wěn)定性和蛋白質翻譯效率指標進行聯(lián)合優(yōu)化,可在10分鐘內找到比天然序列更加穩(wěn)定且蛋白質表達水平更高的新冠mRNA疫苗序列,真正實現(xiàn)了在最短時間內用最高的效率得出最優(yōu)化的方案。目前,LinearDesign算法在提高編碼蛋白的穩(wěn)定性和免疫原性方面的有效性已在體外和體內實驗中得到驗證。2020年8月,百度與斯微生物達成合作,基于LinearDesign算法開展mRNA疫苗分子的體內和體外試驗,并與基于傳統(tǒng)方法設計的基準序列進行了頭對頭的對比。2021年10月,實驗結果公布:在穩(wěn)定性、蛋白質表達水平以及免疫原性等多個衡量疫苗的重要指標上,LinearDesign設計的新冠疫苗序列均大幅優(yōu)于傳統(tǒng)方法設計的基準序列,尤其在抗原中和抗體滴度這一衡量疫苗有效性的關鍵指標上,LinearDesign設計的序列最高超過基準序列達到20倍,表示LinearDesign設計的疫苗能夠有效產生免疫保護,其實際有效性和應用于生物制藥領域的巨大價值被充分驗證。百度LinearDesign算法設計的七條疫苗序列(A-G)以及基準序列(H)等相關信息百度表示,mRNA與生物計算的結合將使得這一進程更加快速、高效,并可能為未來的藥物研發(fā)提供全新思路,同時,除了應用于新冠mRNA疫苗研發(fā),LinearDesign還能用于傳染病疫苗、腫瘤疫苗、單抗等各種疫苗和藥物的研發(fā)。
文章來源:醫(yī)谷